Pourquoi vouloir en même temps faire une séparation stricte et pourtant vouloir contrôler la présentation à coup d'attributs HTML target ? C'est soit l'un soit l'autre.

Faire un javascript avec <a href="mapage.html" onclick="window.open(this.href)"> n'y changera rien. Le validateur HTML ne râlera plus, mais dans les faits vous ne respecterez pas plus le principe du modèle strict. Si vous voulez vraiment contrôler l'interface utilisateur à l'aide de code au milieu de votre document, c'est que vous ne faites pas une séparation stricte entre la description du contenu et sa présentation. Vouloir mettre une déclaration stricte pour votre HTML ne trompera que vous, ça ne changera rien pour vos clients ni pour la maintenance de vos pages.

Utiliser le modèle transitionnel n'est pas mal en soi, c'est simplement une philosophie de conception de la page. Si c'est la vôtre, alors ne vous cachez pas : Utilisez les outils pour ça, utilisez une déclaration de HTML transitionnel et l'attribut target. Cela sera supporté partout et plus accessible que les onclick ou autres astuces javascript.

Si vous choisissez le modèle strict (et je vous le conseille), alors considérez qu'il n'est pas une bonne idée de spécifier " ce lien doit s'ouvrir dans une nouvelle fenêtre " au milieu du HTML. Le problème ne vient pas de l'attribut target en lui-même, mais simplement de votre but de contrôler l'interface utilisateur en modifiant le balisage du document.